Prebiyotiklerin de, probiyotikler gibi sindirim sistemine benzer yararları var. Yapılan araştırmalara göre bazı prebiyotikler, ülseratif kolit gibi bazı bağırsak hastalıklarından kaynaklanan iltihapları önlüyor. Kolesterol ve trigliserid seviyelerini düzenliyor, kolorektal kanserlerin oluşumunu engelliyor ve bağışıklık sistemini güçlendiriyor.
Anadolu Sağlık Merkezi'nden gelen bilgilere göre şimdilik hangi prebiyotiğin, hangi hastalıklara iyi geldiği tam olarak bilinmiyor. Ayrıca birçok ürünün içeriğinde de ne kadar prebiyotik bulunduğu gıda etiketlerinde belirtilmiyor. Fazla miktarda tüketilen prebiyotik de ağrı, ishal, karında gaz ve şişkinliğe neden oluyor.
